Родился 27 мая 1969 года в Тибете в городе Чамдо района Багщот. До 15 лет обучался в школе, где изучал тибетскую грамматику, математику, историю Тибета. Сдав экзамены, поступил на учебу в монастырь Сэра, где обучался один год. Первым его учителем был Мащин Лобсан Тензин Гьямцо Ринпоче - один из главных учителей монастыря Сэра. От Тензин Гьямцо Ринпоче он получал устные наставления, объяснения по ритуалу "Джигжед Пачиг" (Одиночный Ямантака). Также получил наставления по правилам изготовления "торма" (подношения божествам). Получил непосредственные навыки подготовки к посвящениям Белой и Зеленой Тары, Ваджрапани, Гаруды. В двадцать лет получил обеты гелонга от Мащин Лобсан Тензин Гьямцо Ринпоче. В течении семи лет Гендун Гьялцен находился возле своего учителя в качестве помощника. В 1990 году покинул Тибет, пересек Гималаи и прибыл в Индию. Основной целью было увидеть Его Святейшество Далай-ламу и продолжить свое обучение в Индии. В этом же году он поступил в Гоман-дацан, где до 1995 года обучался буддийской философии под руководством учителей Йонтен Дамчу, Ген Лобсан, Ген Йонтен Дамчу, Ген Лобсан, Ген Еше Гьялцен. В 1995 году по просьбе Хамбо-ламы Будаева Чойдорже Гоман-дацан направил группу учителей в Бурятию в институт "Даши Чойнхорлин" в качестве преподователей.
В Буддийском институте "Даши Чойнхорлин" он преподает тибетскую грамматику, разговорный тибетский язык, буддийскую философию, заучивание текстов (Цогчен), Ламрим, историю буддизма. В 1995 году с ректором института Балден-ламой находился в качестве экзаменатора в 16 дацанах Бурятии, принимая экзамены у студентов и абитуриентов Буддийского института. В 1998 году после окончания договора уехал из Бурятии в Индию. По просьбе Пандидо Хамбо-ламы Дамбы Аюшеева и ректора буддийского института Дагбы Очирова вновь был направлен в качестве учителя в Бурятию.

Коренные Учителя Ген Гендуна